Das angeborene Immunsystem ist ein erster Schutz gegen eindringende Pathogene. Das angeborene Immunsystem gegen Viren ist auf Systemebene schlecht verstanden, da es nicht bekannt ist, wie RIG-artige Rezeptoren (RLRs) virale RNA und Genome qualitativ und quantitativ erkennen. Obwohl RIG-I-Liganden in vitro charakterisiert sind, ist unklar, welche RNA-Moleküle in einer lebenden Zelle durch RLRs gebunden werden und wie verschiedene RLRs in der sensiblen aber robusten Interferonantwort zusammenarbeiten. Ausgehend von unserem strukturell-mechanistischen Verständnis der RLRs wollen wir aufklären, wie RLRs mit viraler und zellulärer RNA auf Systemebene interagieren. Dazu haben wir die PAR-CLIP-Methode auf Virus-infizierte Zellen angepasst und können damit untersuchen, welche Epitope und RNA-Moleküle durch unterschiedliche RLRs in einer virus-spezifischen Art und Weise erkannt werden. Dieser Ansatz soll auch die noch unbekannten Liganden für die RLRs MDA5 und LGP2 aufzeigen. Mutationen, die RLRs in funktionell relevanten Aktivitätszuständen fixieren, sollen die Rolle der ATPase-Aktivitäten von RLRs aufklären, z.B. die Verbesserung des Signal-Rausch-Verhältnisses des Systems. Das langfristige Ziel ist, zu verstehen, wie quantitative und qualitative Wechselwirkungen der RLRs mit ihren Liganden mit der Stärke der Interferon-Produktion korreliert sind.

Simon Runge

Charlotte Lässig

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